进入镰仓时代，按照习惯地方领主的土地由长子继承，次子及其他儿子要开拓新土地，这些人到达一个新地方后，就取一个地名，也将此当作苗字，比如开垦的土地靠近山脉就取名「山本」或「山田」，靠近河流的上游就取名「川上」或「上田」，这样一来因领主分家导致一大批以地名为的苗字出现。
此时，下级武士也效仿领主纷纷取苗字，见人以苗字自报家门，日本人的姓氏就逐渐膨胀起来。另外，农民为保护自己的土地，许多村落组织了小规模的武装，这些村落的农民也继承了祖先的苗字。
因此，通过日本人的姓氏就可以判断出他们祖先的职业，比如姓氏中有田、山、野、川等基本来自农村，而向东条、南条、十三条等姓氏的人，他们的祖先大多数居住在城里，以工商业者居多。而犬养、猪饲等形式，他们的祖先应该是畜牧业者。
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