基隆之战可谓大获全胜，不仅获得了一个优良的港口和一个生活设施齐配的寨子，还缴获了二艘大海船、二十四艘中型海船和四十余艘轻快小船。有了这些船只，可以让流求公司的海上力量快速成型。除了廖泥鳅最看重的船只外，还缴获了大量的粮食和金银丝帛及珠宝玉器，这些东西都是海匪多年抢劫积攒下来的，如今成了霹雳军在流求获得的第一桶金。那四五百名海匪，除了战死一百余人外，大部分人做了俘虏。实际上海匪要逃出寨子霹雳军也拦不住，只不过没有了船只能往那里逃？逃到附近的丛林中，被食人生番捉住的下场，仅想想就令人不寒而栗。
接到廖泥鳅占领基隆的消息后，舟山岛上的众人便忙碌起来，将人员和物资运往流求岛。要将几千人和包括粮食、盐布匹及工具等大量的生产生活物资运到岛上，又要注意保密，实在是个艰难之事。好在廖泥鳅派了三十余艘大中海船回来，李开鹏又从其他商号甚至官军水军处租了不少运输船，故经过半月有余的忙碌，舟山岛上的霹雳军人员和物资基本运送到基隆。这也让舟山的地方官长舒了口气。
在舟山的官员看来，这些来自川西的兵卒手握四川制置司的公文，又和朝中高官有千丝万缕的联系，惹不起还捞不到多少油水。这些人还以朝廷允许为由大量招募流民，要带回川西屯垦。这些无业流民虽有约束并未闹出麻烦，但一直留在舟山终究是个隐患。如今他们一并走了，便还了一众官员的清静。至于他们是回川西，还是到流言所称的海外，便与舟山地方官不甚相干了。
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