第四中心医院的专家们在广泛征求了业内专业人士的意见后，并没有采取相对保守的辐射总量。而是采用了脓肿区单点辐射剂量170Gy/min，水肿区辐射剂量80Gy/min，总辐射量1000Gy的方案。
这个辐射量超过了一般临床治疗脑肿瘤的处方剂量的五倍，对于任何患者来说，接受如此大剂量的辐照都是会有极大风险的。虽然伽马刀具有辐射区域准确，对其他器官损伤小的特点。但仍然无法彻底避免患者其余组织受到影响。而这种影响，尤其会在巨大辐射量下表现的更为明显。
对于杨建强来说，伽马刀最致命的风险有三个。第一，是辐射可能会对他的小肠绒毛造成严重损伤，这也是绝大多数急性辐射病的主要发病原因。第二，是大剂量辐射后可能产生的微血管迟发性损伤。当这种损伤发生在脑部区域的时候，很可能会出现微血管水肿，从而导致脑血栓或者供血不足。而第三个风险，则是大剂量辐射下，可能造成连带的脑组织死亡。
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