2011年6月8日诺伊尔前往拜仁慕尼黑体检，并和拜仁正式签约一份至2016年6月30日期满的五年合约，诺伊尔正式转会到拜仁慕尼黑，成为拜仁慕尼黑新一号门将，转会费高达两万欧元并附加有和成绩挂勾的后续条款，成为德甲历史上身价最贵的门将。
而在此之前沙尔克庆祝德国杯夺冠的游行上，还发生了一件事，一些盖尔森基兴的极端球迷趁他没注意的时候打了他一记耳光，这也可以看出沙尔克球迷当时对他的离开是多么生气了。
不过在2011年7月31日诺伊尔以二百一十票当选德国权威杂志《踢球者》最佳球员，亦即2010-2011赛季德国足球先生。
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