2003-2004赛季范佩西已经和范马尔维克彻底决裂，在大多数比赛中只能坐在板凳上，范佩西在这个赛季各项比赛中出场了三十三场仅打进六球，这时的范佩西拒绝和费耶诺德续约，双方关系已经彻底决裂于是费耶诺德开始主动兜售范佩西，但很多豪门忌讳于他的前科而非常谨慎，而当时正致力于寻找博格坎普的接班人的阿森纳看中了范佩西。
2004年5月14日范佩西正式签约阿森纳，转会费仅有二百七十五万英镑，而在他加盟之时阿森纳队主教练温格表示，范佩西在阿森纳队内的位置将从他过去习惯的左边锋改到中路，他会成为博格坎普的接班人，在亨利的身后担任影锋。
2004-2005赛季中范佩西在阿森纳对阵曼联的社区盾杯决赛中首次代表阿森纳出场，而阿森纳最终三比一击败了曼联，范佩西收获了他来到英格兰以后的第一个冠军。赛季初期范佩西难以和何塞·安东尼奥·雷耶斯、丹尼斯·博格坎普和弗雷德里克·永贝里等人竞争，因此他的大部分时间是替补。10月阿森纳对阵曼城的比赛中首次首发出场，并且打进了他在阿森纳的第一个进球。
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