朝鲜国内的这次事件某种意义上可以看做一次清洗，其后果应该说还是比较严重的。例如金德龄后来便在长期的严刑拷问中死去，郭再佑也宣告退隐，兵曹判书李德馨愤而辞职，被转任训练都监。
除了这些直接影响之外，各地义军因此颓废不振，加深了对朝鲜王的失望，这类间接影响可能更加严重。
柳祖訒及李尔瞻就伊斗寿烧毁供词，向朝鲜王求情一事向世子光海君倾诉。李尔瞻道：“细想起来，此事应该不是伊斗寿个人便能主导，如今王上只要认为对自己不利便会让其去职。不过若仍在当下还有可用之处则不会丢弃，这从让准备离开朝廷的兵判李德馨转任训练都监留在身边便是例证。”
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